उन्हें भारतीय दंड संहिता (आईपीसी) की धारा 120बी (षड्यंत्र), गैरकानूनी गतिविधियां (रोकथाम) अधिनियम (यूएपीए) की धारा 38 (आतंकवादी संगठन की सदस्यता) और धारा 39 (आतंकवादी संगठन का समर्थन) के तहत दंडनीय अपराधों का दोषी पाया गया और तदनुसार उन्हें दोषी ठहराया गया। अदालत ने इन सभी अपराधों में प्रत्येक को आठ साल के कारावास की सजा सुनाई। हालाँकि, अदालत के आदेशानुसार, यह सज़ा साथ-साथ चलेगी।
यह मामला 2019 में तब दर्ज किया गया था जब सूचना मिली थी कि अज़हरुद्दीन और उसके साथी प्रतिबंधित आतंकवादी संगठन ISIS की विचारधारा का प्रचार कर रहे हैं और दक्षिण भारत, खासकर केरल और तमिलनाडु में आतंकवादी हमले करने के लिए कमज़ोर युवाओं की भर्ती करने के इरादे से ऐसा कर रहे हैं। यह जाँच अप्रैल 2019 में श्रीलंका में ईस्टर के दिन हुए आतंकवादी हमले के बाद की गई थी। एनआईए ने आरोप लगाया कि आरोपी श्रीलंका के अनवर-अल-अवलाकी, अबू बारा, मूसा सेरान्टोनियो, ज़हरान हाशिम जैसे कट्टरपंथी वक्ताओं के भाषण देखते थे।
एनआईए के अनुसार श्रीलंकाई ISIS नेता ज़हरान हाशिम के भाषण और अन्य सामग्री आरोपियों के डिजिटल उपकरणों और सोशल मीडिया अकाउंट से फोरेंसिक जाँच से बरामद की गई थी। 2017 से मार्च 2019 तक, उन्होंने दक्षिण भारत में ISIS की गतिविधियों को बढ़ावा दिया। एनआईए ने कहा कि आरोपी 2017 से केरल में कई जगहों पर गए, विभिन्न स्थानों पर अपने साथियों से मिले और आईएसआईएस को अपना समर्थन दिया। दोनों 2022 के कोयंबटूर विस्फोट मामले में भी आरोपी हैं।

